蛋白质比较
结论
Gurobi
原文使用了Gurobi
请参见代码ProteinComparison_Gurobi.py
运行结果如下
Maximum number of edge matches: 5 |
COPT
COPT 无法对该模型做出正确的判断
在该模型中,对于同一个.lp
或.mps
文件,使用Gurobi求解,能得到Optimal solution
而对于COPT,返回的结果如下
Quadratic objective is not convex
所使用的代码如本文件夹附带的test.py
从结果来看,该模型被copt自动识别为MIQP模型,返回结果模型非凸
对此问题我也发邮件咨询过COPT的技术支持,但并未得到回复
于是弃用此求解器
- 2023.10.23 收到了来自COPT官方的回复,回复如下
他们表示没有做出非凸的求解器,仍在开发
OR-tools
请参见代码ProteinComparison_ORTOOLS.py
返回结果如下
Maximum number of edge matches: 9 |
本博客所有文章除特别声明外,均采用 CC BY-NC-SA 4.0 许可协议。转载请注明来源 TwoOnefour的博客小窝!
评论